红豆杉的功效主要包括温肾通经、利尿消肿以及祛邪散结等，有辅助调理高血压、高血糖及高尿酸血症等症的作用。
红豆杉的根、茎及叶均可以入药，其药性寒，味甘、苦，归肾经和心经，临床上常用于辅助治疗月经不调、产后瘀血以及痛经等，还能辅助治疗糖尿病、肾炎浮肿和淋病等病症，食用方法是遵医嘱跟其他药物煎汤后内服，也可以将红豆杉鲜果洗净后泡药酒饮用，但红豆杉性寒，所以不适合脾胃虚寒及体质虚弱的人使用，避免使用不当产生不良影响。
除以上功效与作用外，将红豆杉在室内种植，还能吸收二氧化碳并释放氧气，起到净化空气的作用。