苍耳子可能会引起胃肠道反应、肝脏损伤、肾脏损伤等副作用，日常使用需要注意药物用量。
1、胃肠道反应：苍耳子属于一味中成药，能够起到散风祛寒、祛湿止痛等功效，但是药物具有刺激肠胃的副作用，有可能会引起恶心、腹胀、便秘等症状，苍耳子尽量在饭后服用，减轻肠胃负担。
2、肝脏损伤：苍耳子会经肝脏吸收，过量服用或长期使用可能会引起肝细胞受损，患者会出现转氨酶升高的症状，需要根据自身的情况适当停药。
3、肾脏损伤：一次性大量服药，药物的毒副反应也可能会伴随着肾功能衰竭，导致少尿、血尿等症状，需要在专业医生指导下选择合适的剂量。
除此之外，还可能会引起过敏。