制何首乌的副作用通常包括恶心、呕吐、腹泻、头晕等症状，严重时可能会出现躁动、抽搐、呼吸麻痹等症状。
制何首乌具有一定毒性，因为富含的成分包括蒽醌类，如果长期大量服用会刺激胃肠道，出现肠鸣、恶心、腹痛等症状，时间长了还会导致腹泻。如果何首乌与食用材料搭配错误，如葱、蒜、猪肉等，患者服用后会出现头晕眼花症状，严重时还会出现躁动不安、抽搐、呼吸麻痹等。
在用药期间需要饮食清淡，避免辛辣刺激食物，还要严格在医生指导下使用，避免用药不当，产生不良反应。
