找到病因是治病的重中之重，只有找到病因才能更有针对性的实施治疗。慢性肾功能衰竭患者的肾功能主要依靠残存的完美肾单位来维持。任何加重肾脏负荷的因素，均可加重肾功能衰竭;因此应积极消除诱发肾功能恶化的有害因素，例如操纵感染，减轻高血压等。此外，还应矫正水、电解质紊乱，纠正酸中毒等以维持内环境的稳定。关于比较严重的，治疗肾病肾功能衰竭患者出现尿毒症时，应采取抢救措施以维持内环境的稳定。常用的措施有腹膜透析、血液透析，必要时可能也可进行肾脏移植。
治疗肾衰竭，大多数病人会使用激素物，激素物固然疗效尚佳，但总会出现副作用，这是令病人们十分头痛不堪的。透析的方法治疗尿毒症、肾衰等病症，长期导致肾脏等脏器会逐渐萎缩、衰竭;终要移植肾脏，而存活期也是有限的，另外换肾有排异反应等因素影响。因此，肾衰竭宜选用中医辅助治疗，以减少西医治疗的副作用。