不少人认为，人们呼出的难闻气味是口腔疾病或早晨忘了刷牙所致。然而，现代医学已经证明很多全身性疾病，如肝、肺、肾、胃有病也会引起口臭，如果经常出现要寻找病因。
腐败味——上呼吸道疾病。鼻窦炎、扁桃体炎和咽喉炎等上呼吸道疾病都会分泌大量含蛋白质的黏液，部分形成鼻涕，剩下的从鼻道流入口咽部。这些黏液部分黏附于舌根后部或口咽部，当蛋白质分解后，就会产生腐败味。
酸臭味——胃病。胃幽门部狭窄或梗阻时，食物在胃内留置时间过长，会产生酸臭腐败的气味，通过口腔散发出来。反流性食管炎等胃病还可导致病理性口臭，黏附在口腔、咽喉部位的呕吐物不停释放“酸气”。通常在积极治疗胃病后，口臭能得到显著改善。
烂苹果味——糖尿病丙酮酸中毒。当一个人血糖超标，未加控制时，体内的脂肪分解，就会产生酮体，其中的α-酮戊二酸会发出一种酸酸的烂苹果味道。当呼出这种气味时，患者体内的酮体浓度已经非常高了，接近或达到糖尿病酮症酸中毒的水平，需要及时就医，否则会有生命危险。
尿臊味——尿毒症。尿臊味多是患有慢性肾炎或肾病的患者发出的。病程进展到慢性肾功能衰竭阶段(俗称尿毒症)时，由于无尿，某些毒性物质不能排出体外而潴留于血中，就会使病人呼出的气体散发出尿味，这是病情趋于危重的信号。
此外，早上口苦，一般跟肝胆有关，多是因为压力大、精神紧张，肝脏的疏邂能力比较差，造成淤积；口中老有酸味儿可能是肝的虚证或肝胃不合；口黏和口淡无味往往合在一起，嘴里黏黏的，早上起来老想喝点水漱口，或者过一段时间就觉得嘴里黏了，多是比较胖，不爱动，喜欢吃肉的人，是湿的表现；口臭多是慢性牙周炎或胃肠积热，便秘、吃得多、消化不良的人容易口臭，毛细胆管炎、肝脏的代谢能力差，别人闻起来有腥臭味；如果嘴里呼出来的是臭鸡蛋味儿，就要看看肾脏有没有问题。